計(jì)算基因組學(xué)旨在發(fā)展理論和方法學(xué)，對(duì)基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘、信息提取。其中對(duì)遺傳多態(tài)性，如基因頻譜、單倍型結(jié)構(gòu)等進(jìn)行建模，利用群體基因組水平的遺傳變異數(shù)據(jù)來(lái)推斷群體的歷史和變遷是群體遺傳學(xué)的核心內(nèi)容。傳統(tǒng)的群體遺傳學(xué)分析方法通?；谛颖緮?shù)據(jù)。日前，中科院北京基因組所陳華課題組提出一個(gè)群體遺傳學(xué)新算法，相關(guān)成果發(fā)布于《分子生物學(xué)與進(jìn)化》雜志。

    日新月異的測(cè)序新技術(shù)正在產(chǎn)生海量的基因組序列數(shù)據(jù)，這些大樣本或群體水平的測(cè)序數(shù)據(jù)為基因組時(shí)代的群體遺傳學(xué)研究提供了前所未有的機(jī)遇。陳華課題組的新方法克服了大樣本時(shí)的數(shù)值計(jì)算問題，首次實(shí)現(xiàn)了對(duì)大樣本全基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行高效計(jì)算的群體遺傳學(xué)分析，可用于檢測(cè)群體的增長(zhǎng)模式，有效推斷一萬(wàn)年以內(nèi)的群體大小變化的相關(guān)參數(shù)。新算法擁有若干計(jì)算上的優(yōu)勢(shì)：該方法給出解析形式的公式，不依賴于仿真，計(jì)算便捷高效，而且在大樣本時(shí)無(wú)數(shù)值問題；具有很好的靈活性，能涵蓋復(fù)雜的群體模型。