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Evogene利用計(jì)算機(jī)技術(shù)發(fā)現(xiàn)新的抗蟲(chóng)微生物候選基因

時(shí)間:2015-08-07     來(lái)源:世界農(nóng)化網(wǎng)
世界農(nóng)化網(wǎng)中文網(wǎng)報(bào)道: Evogene 近日宣布,該公司順利完成尋找新微生物基因的首輪計(jì)算開(kāi)發(fā)過(guò)程,并通過(guò)一種獨(dú)特的計(jì)算技術(shù)成功發(fā)現(xiàn)抗蟲(chóng)候選基因,該技術(shù)具有一個(gè)專利的微生物數(shù)據(jù)庫(kù)以及專業(yè)數(shù)據(jù)分析平臺(tái)BiomeMiner TM。 

    公司位于美國(guó)密蘇里圣路易斯的研發(fā)機(jī)構(gòu),將針對(duì)鱗翅目和鞘翅目靶標(biāo)昆蟲(chóng)如玉米根蟲(chóng)和玉米螟蟲(chóng)開(kāi)展抗蟲(chóng)候選基因的功能性驗(yàn)證工作,預(yù)計(jì)明年完成。 

    Evogene微生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)目前涵蓋數(shù)以百萬(wàn)計(jì)的微生物基因,該數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)源廣泛,包括公共微生物數(shù)據(jù)以及專有富含抗蟲(chóng)特性的試驗(yàn)樣品數(shù)據(jù)庫(kù)。該數(shù)據(jù)庫(kù)的獨(dú)特性在于可以整合海量分散而復(fù)雜的宏基因組學(xué)數(shù)據(jù)。 

    BiomeMiner TM分析平臺(tái)利用高級(jí)機(jī)器學(xué)習(xí)算法,快速識(shí)別并優(yōu)化排序帶有抗蟲(chóng)性狀的基因。該平臺(tái)基于數(shù)據(jù)庫(kù)種的海量微生物基因池快速篩選帶有抗蟲(chóng)性狀的候選功能基因。