稻屬是從事植物比較、進(jìn)化和功能基因組學(xué)研究的理想系統(tǒng)。野生稻蘊(yùn)含著寶貴的基因資源。為了更好地利用稻屬的野生資源,美國亞利桑那大學(xué)的Rod Wing教授在2009年發(fā)起了國際稻屬基因組計劃(I-OMAP),旨在構(gòu)建稻屬所有物種的全基因組序列圖譜,并在此基礎(chǔ)上開展比較、進(jìn)化和功能基因組學(xué)研究。
在I-OMAP計劃的框架下,中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所陳明生課題組通過與深圳華大基因、亞利桑那大學(xué)等合作,利用第二代測序技術(shù)完成了261 Mb高質(zhì)量的短花藥野生稻(O.brachyantha)全基因組序列,并開展了稻屬比較基因組學(xué)和基因組進(jìn)化的研究。研究揭示了稻屬基因組在基因組大小、基因移動和異染色質(zhì)進(jìn)化等方面新的分子機(jī)制。該研究于3月12日在線發(fā)表于Nature Communications。