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我國“合成生物學”急需研究哪些問題?

時間:2011-09-26     來源:科學時報
總體來說,發(fā)展合成生物學的目標和目的應該包括國家在材料、能源、化工產品方面的重大需求,逐漸減少對石油的依賴。發(fā)展一個逐漸可以與化工過程競爭的工業(yè)生物產業(yè)?!  ?/p>


  《科學時報》:目前合成生物學研究面臨的主要挑戰(zhàn)是什么? 


  陳國強:有很多挑戰(zhàn),最大的挑戰(zhàn)也許是新生命的合成。如何合成出一個有新特征的生命?對于工程應用領域來說,重要的是合成出一條新的代謝路徑,獲得野生微生物不能合成的產物。為此,要全面了解微生物的調控機制。比如說,把相關基因拼到一起(或合成)之后,可能會合成出一個微生物的代謝通路,但是它沒有按照預期目標去大量合成所需要的產物。因為在細胞里面,有大量基因參與調控,如果不清楚它的功能,把它精簡掉之后就會出問題,得不到我們希望的產物??傊?,細胞沒有按照所需要的方向發(fā)展。所以這些調控的東西影響了我們隨心所欲地設計某種生物的企圖。如果知道了所有的調控的機制,挑戰(zhàn)就小了許多。不過,還有另一個挑戰(zhàn)是,如果設計出來的生物體控制不住怎么辦? 


  《科學時報》:國際上對合成生物學研究主要集中在哪些方面? 


  陳國強:可能最令人矚目的是具有新功能的新生命的合成吧。這主要是滿足人類的好奇心。其他的主要集中在工程和應用。第一個方面就是所謂最小基因組的研究。一般來說,基因組越小,細胞生長得越快。其原理主要是DNA合成和代謝負擔減少了。最小基因組研究就是通過有目的刪除多余基因,獲得在特定條件下有優(yōu)勢的簡化基因組微生物?!?/p>


  另外就是合成路徑的研究。在最小基因組研究的基礎上,用各種基因組成的元件拼裝成某種產物的合成代謝路徑??梢允且粭l利用二氧化碳光合作用合成氫氣的代謝路徑,可以是一條合成紫杉醇的代謝路徑……有無窮無盡的可能性,使這個細胞在滿足生長的最低要求后,集中精力去生產你需要的產品。 


  第三,就是模塊化研究。就是把各種功能的基因模塊化,等到需要的時候把各個功能模塊組裝起來就可以了。像積木玩具一樣,通過不同的組合,變成房子、汽車、飛機等不同的東西?!?/p>


  《科學時報》:我國開展合成生物學研究、發(fā)展合成生物學的目的是什么?針對國家什么樣的重大需求? 


  陳國強:我國是一個資源消耗大國,在材料、能源、化工產品的消耗量方面等都居世界第一位,所以,我國開展合成生物學的目標就應該包括解決材料、能源、化工產品的重大需求。因此,發(fā)展合成生物學的主要目的應該包括逐漸減少對石油的依賴,利用農業(yè)生物質如纖維素、非糧淀粉、非糧脂肪酸等為原料生產材料、能源、化工產品等??傮w來說,發(fā)展合成生物學的目標和目的應該包括國家在材料、能源、化工產品方面的重大需求,逐漸減少對石油的依賴。發(fā)展一個逐漸可以與化工過程競爭的工業(yè)生物產業(yè)。當然,合成生物學的研究也將產生許多研究生命活動的重大科學問題?!?/p>


  《科學時報》:不少國家都發(fā)布了合成生物學路線圖,我國也在制定過程中,您認為作為路線圖應強調哪些問題? 


  陳國強:我認為未來合成生物學要利用系統(tǒng)生物學的方法研究微生物——主要是細菌的工業(yè)應用,使微生物最大程度地生產工業(yè)產品包括材料、精細化工產品和生物燃料等。利用合成生物學的手段構建(合成)新的微生物,能夠最優(yōu)地進行工業(yè)發(fā)酵。最終的目的是實現(xiàn)復合功能微生物的構建?!?/p>


  《科學時報》:您長期從事PHA材料方面的研究,合成生物學為這一領域注入哪些新內容?會產生哪些變革? 


  陳國強:PHA的合成需要微生物的高速生長和PHA的大量積累來實現(xiàn),這也是降低PHA生產成本的關鍵。所以,如何構建最小基因組的微生物來實現(xiàn)上述目的,是我們實驗室重要的研究方向。通過基因組、轉錄組、蛋白質組和代謝組以及代謝流量組的全盤研究,尋找與PHA合成關系不大、對細菌生長不是必要的基因進行刪除,獲得能高速生長和大量積累PHA、從碳源到PHA轉化率高的最小基因組微生物。